企業(yè)申請食品經營許可證需要準備以下申請材料：

食品經營許可申請書：企業(yè)需在食品經營許可申請書上詳細填寫申請許可的經營項目、經營場所、倉庫地址、主要負責人、經營規(guī)模等信息，并加蓋公章或簽字。

營業(yè)執(zhí)照或者其他主體資格證明文件復印件：企業(yè)需提供營業(yè)執(zhí)照或其他主體資格證明文件復印件，以證明其具備經營該類食品的資質。

與食品經營相適應的主要設備設施布局、操作流程等文件：企業(yè)需提供與食品經營相適應的主要設備設施布局、操作流程等文件，包括主要設備設施布局圖等，以證明其具備符合要求的生產經營條件。

食品安全自查、從業(yè)人員健康管理、進貨查驗記錄、食品安全事故處置等保證食品安全的規(guī)章制度：企業(yè)需提供食品安全自查、從業(yè)人員健康管理、進貨查驗記錄、食品安全事故處置等保證食品安全的規(guī)章制度，以證明其有能力保證食品安全。

食品安全管理員制度：企業(yè)需提供食品安全管理員制度，明確食品安全管理員的職責和工作制度，以證明其有能力保證食品安全。

《授權委托書》及被委托人身份證明復印件：如果企業(yè)委托代理人提出許可申請時提交，需要提供《授權委托書》及被委托人身份證明復印件。

其他相關材料：根據當地食品藥品監(jiān)督管理局的要求，企業(yè)還需提供其他相關材料，如食品安全培訓計劃、食品安全管理規(guī)章制度等。

需要注意的是，不同地區(qū)的食品藥品監(jiān)督管理局對申請材料的具體要求可能有所不同，企業(yè)需按照當地要求準備申請材料。企業(yè)應當保證所提供的申請材料真實有效，并承擔相應的法律責任。